<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<rss version="2.0" xmlns:atom="http://www.w3.org/2005/Atom" xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005">
<channel xmlns:cfi="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005/internal" cfi:lastdownloaderror="None">
<title cf:type="text"><![CDATA[《新中医》编辑部 -->网络药理]]></title>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学探讨大黄治疗儿童功能性便秘的作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20212301肖剑秋1-5]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：采用网络药理学探讨大黄治疗儿童功能性便秘（FC） 的作用机制。方法：通过TCMSP 数据库获取大黄的主要活性成分和作用靶点，利用Genecards 数据库检索出FC 的潜在靶点，再筛选以上两者的共同靶点，获得靶蛋白之间的相互作用关系，采用Cytoscape3.7.2 软件绘制“大黄-活性成分-靶点-FC”相互作用网络图，最后对交集靶点进行蛋白互作网络（PPI）分析，GO 功能分析和KEGG 通路富集分析。结果：收集到大黄有效活性成分16 个，所对应基因靶点37 个，FC 基因靶点4 521 个，大黄和FC 共同交集靶点为26 个。PPI 结果显示：大黄中的CASP3、MYC、ESR1、HSP90AA1、CCNB1、CASP8 等为治疗FC 的核心靶点。GO 功能分析显示靶点基因主要富集于对类固醇激素的反应、对雌二醇的反等。KEGG 通路富集分析主要包括化学致癌作用-受体激活、乙型肝炎、人类免疫缺陷病毒1 型感染、脂质和动脉粥样硬化信号通路、PI3K-Akt 信号通路、神经退行性疾病信号通路、p53 信号通路、胆碱能突触和雌激素信号通路等对FC 产生治疗作用。结论：大黄通过多成分、多靶点和多通路治疗FC，但其机制仍需进一步体内体外实验证实。]]></description>
<pubDate>2021/12/10 12:09:47</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[肖剑秋，谢忠罗，何炜，吴百威]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20212301肖剑秋1-5]]></guid><cfi:id>17</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学探讨通冠胶囊治疗动脉粥样硬化的作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20212001李锦伟1-6]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：利用网络药理学方法探讨通冠胶囊对动脉粥样硬化性疾病的作用机制。方法：采用TCMSP 数据库和文献挖掘方法对通冠胶囊的药物化合物及靶点进行筛选；通过GeneCards 及DisGeNET 数据库检索动脉粥样硬化性疾病的相关靶点；通过Cytoscape 3.8.0 软件构建通冠胶囊药物-靶点-疾病网络及核心网络，通过STRING 数据库构建其PPI 网络。截取通冠胶囊作用于动脉粥样硬化性疾病潜在靶点于DAVID 网站进行KEGG 及GO 富集分析。采用R 软件对将上述信号通路、生物学过程、分子功能、细胞组成信息进行可视化处理。结果：共获得通冠胶囊化合物123 个，通冠胶囊药物靶点272 个，对应化合物111 个；动脉粥样硬化性疾病靶点576 个。形成通冠胶囊药物与动脉粥样硬化靶点交集图，共有NR3C1、DPP4、ESR1、MAPK14、PPARG、PTGS2 等61 个共同靶点，相应化合物101 个。PPI 网络中共得到56 个相互连接的节点，288 条边。KEGG 与GO 分析后得到通冠胶囊可能作用于动脉粥样硬化的NOD 样受体信号通路、癌症的途径、VEGF 信号通路等22 条通路。结论：通冠胶囊可通过作用于NR3C1、DPP4、ESR1、MAPK14、PPARG、PTGS2 等61 个共同靶点，调节胰岛素信号通路，发挥抑制炎症反应，调节代谢，抗氧化应激等作用，干预动脉粥样硬化发生及发展进程。]]></description>
<pubDate>2021/10/22 9:04:48</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[李锦伟，魏启明，朱晓峰，孟凡喆，常钢，刘文导]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20212001李锦伟1-6]]></guid><cfi:id>16</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学研究蒲地蓝消炎口服液的药理作用分子机制及与疾病的关系]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202208001张伟1-9]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：基于网络药理学研究蒲地蓝消炎口服液的药理作用分子机制及与疾病的关系。方法：通过已发表的文献查找蒲地蓝消炎口服液的化学成分，利用SwissADEM 网站对有效成分进行筛选，在SwissTargetPrediction 网站中找出概率＞0 的全部预测靶点，在String 网站中构建全部靶点的蛋白质相互作用（PPI） 网络，应用Cytoscape 3.8.0 软件构建PPI 可视化网络，通过CytoNCA APP 进行集中性综合评价，筛选出蒲地蓝消炎口服液的核心靶点。对全部作用靶点进行富集分析，并对作用靶点进行疾病相关可视化分析。结果：筛选出42 种活性成分，624 个作用靶点，核心靶点包括：丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、白蛋白（ALB）、胱天蛋白酶3（CASP3），原癌基因、非受体酪氨酸激酶（SRC），表皮生长因子受体（EGFR）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、信号转导与转录激活因子3（STAT3）、肿瘤坏死因子（TNF）。富集分析结果显示这些靶点主要参与的生物过程包括对氮化物的反应、对毒性物质的反应、跨突触信号传导、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK） 级联调控等。疾病相关可视化分析结果表明这些靶点主要富集于实验室糖尿病、神经系统疾病、肿瘤性疾病。结论：通过网络药理学筛选出蒲地蓝消炎口服液的核心靶点，发现该药可通过核心靶点，在抗炎、促进组织细胞分化、抗肿瘤等方面起到药理作用，对神经系统、肿瘤疾病等存在潜在的治疗作用。]]></description>
<pubDate>2022/4/24 11:03:16</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[张伟，潘梦瑾，郎靖，时艳平，郭劲松，张胜安]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202208001张伟1-9]]></guid><cfi:id>15</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学的血府逐瘀汤治疗继发性闭经作用机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202206002邱嘉菡5-13]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：利用网络药理学方法探讨血府逐瘀汤治疗继发性闭经的潜在作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP） 以及ETCM 数据库查找出血府逐瘀汤中所有药物的活性成分，通过DrugBank 数据库、DisGeNET 数据库、GeneCards 数据库查找继发性闭经相关靶点，利用Cytoscape 3.8.0 软件构建血府逐瘀汤中所有中药的活性成分及对应靶点（活性成分-靶点） 网络。利用STRING 网络数据库构建及扩增血府逐瘀汤与继发性闭经之间的交集靶点蛋白相互作用（PPI） 网络，使用Cytoscape 3.8.0 软件绘制PPI 网络图。通过DAVID 数据库对核心靶点进行基因本体（GO） 分类富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG） 通路富集分析。结果：筛选出163 个血府逐瘀汤作用靶点，其中与继发性闭经相关的作用靶点有34 个，扩增以后一共得到64 个相关靶点。血府逐瘀汤主要通过作用于白细胞介素-6、肿瘤抑制因子P53 等靶点，调控类固醇功能、肿瘤信号通路等多个生物过程及通路，来发挥治疗继发性闭经的作用。结论：血府逐瘀汤可作用于继发性闭经患者的多个靶点，参与多条信号通路的调控。]]></description>
<pubDate>2022/3/25 17:30:42</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[邱嘉菡，邝梓君，曾蕾，袁烁，曾诚]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202206002邱嘉菡5-13]]></guid><cfi:id>14</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学探讨四君子汤治疗克罗恩病的作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202205003袁红昌14-22]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：采用网络药理学方法探讨四君子汤治疗克罗恩病的作用靶点和信号通路。方法：通过美国国家生物技术信息中心（NCBI） 预测克罗恩病的疾病靶点，中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP） 筛选四君子汤的主要活性成分和靶点信息。采用Cytoscape 3.7.2 软件Bisogenet 包构建蛋白质相互作用（PPI） 网络，ClusterProfiler R 包进行靶点基因本体（GO） 分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG） 通路富集分析。结果：预测灌木远志酮A、3β-乙酰氧基苍术酮、常春藤素、槲皮素及山奈酚等98 个活性成分，主要作用于T 细胞表面抗原CD26（DPP4）、一氧化氮合酶2 （NOS2） 及过氧化物酶体增生激活受体γ（PPARG） 等27 个克罗恩病靶点基因，通过白细胞介素（IL） -17 信号通路、肿瘤坏死因子信号通路及利什曼病等24 条信号通路发挥治疗作用。结论：四君子汤是通过多途径、多环节、多靶标发挥治疗克罗恩病的作用。]]></description>
<pubDate>2022/3/10 9:26:20</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[袁红昌，卢乙众]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202205003袁红昌14-22]]></guid><cfi:id>13</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[黄芪甲苷调控氨基酸代谢抗糖尿病肾损害分子网络机制研究]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202205004戈娜22-28]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：应用网络药理技术从氨基酸代谢调控角度分析黄芪甲苷抗糖尿病肾损害网络分子机制。方法：基于前期代谢组学筛选出的与糖尿病肾病进展相关的氨基酸。使用KEGG、PubChem、TCMSP 数据库，检索并提取氨基酸及黄芪甲苷的有效靶标基因，采用KEGG pathway 数据库进行通路分析；应用Cytoscape 绘制黄芪甲苷、氨基酸基因靶标蛋白互作网络图，并提取核心基因靶标。Cytoscape3.7.1 软件内在的ClueGO 应用进行疾病进展相关氨基酸基因靶标的通路、生物过程、细胞定位、分子功能进行富集分析，并绘制网络图。结果：本研究共分析了10 个与糖尿病肾病进展密切相关的氨基酸，提取基因靶标82 个，参与KEGG 通路62 条。提取黄芪甲苷基因靶标24 个。通过构建PPI 网络，拟合黄芪甲苷和氨基酸基因靶标网络，提取核心靶标39 个。富集分析结果表明黄芪甲苷和氨基酸核心基因靶标参与调控细胞应激、转录生长因子调控、蛋白质去乙酰化、RNA 聚合酶调控、DNA 结合调节、细胞周期调控、碳水化合物分解、糖酵解、细胞增殖染色质重塑等生物过程；涉及的细胞定位包括细胞周期蛋白、RNA 聚合酶体复合物、常染色质、转录抑制因子、ATP 酶复合物、PcG 蛋白复合物、组蛋白甲基转移酶、组蛋白去乙酰化酶、SWI/SNF 超家族复合物、Sin3 复合物、CHD 复合物；参与的分子功能有调控组蛋白去乙酰化、DNA 转录因子结合、RNA 聚合酶结合、转录因子活化、染色质DNA 结合、泛素蛋白连接、p53 连接、糖皮质受体结合等；核心基因靶标涉及的KEGG 通路以调控细胞周期、癌症、自噬通路相关通路为主。结论：黄芪甲苷可能通过调节糖代谢、蛋白、DNA 的转录后修饰，在细胞增殖、细胞周期、氧化应激、细胞自噬等多个分子功能层面实施保护糖尿病肾病肾脏的功能。]]></description>
<pubDate>2022/3/10 9:26:20</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[戈娜，林韦翰，黄静婷，古秀芬，吴瑕，李顺民]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202205004戈娜22-28]]></guid><cfi:id>12</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学探讨交泰调脉方治疗冠心病作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202201005杨嫄25-34]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：基于网络药理学探讨交泰调脉方治疗冠心病的潜在作用机制。方法：检索中药系统药理学分析平台（TCMSP） 获得交泰调脉方的成分和靶点，并使用在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、人类基因数据库（GeneCards）、疾病关联数据库（GAD）、药物靶标数据库（TTD）、疾病相关的基因与突变位点数据库（DisGeNET） 等疾病数据库获得冠心病相关靶点。通过取交集得到交泰调脉方治疗冠心病的潜在作用靶点，导入Cytoscape3.7.2 软件构建“方药-成分-靶点”网络。借助STRING 数据库和Cytoscape3.7.2 软件进行蛋白互作分析，并筛选关键靶点和子模块，最后使用DAVID 数据库进行基因本体论（GO） 和京都基因与基因组百科全书（KEGG） 富集分析，使用Reactome 数据库进行Reactome 富集分析，并制作“药物-成分-靶点-通路”图。结果：共获得交泰调脉方成分405 个，作用于冠心病的潜在靶点146 个，包括6 个子模块和10 个关键靶点。交泰调脉方治疗冠心病的主要成分为槲皮素、甘氨酸、β-谷甾醇、（R） -氢化小檗碱、芹菜素等，通过调控缺氧诱导因子-1（HIF-1） 信号通路、神经活性配体-受体相互作用、环磷酸鸟苷酸-蛋白激酶G（cGMP-PKG） 信号通路、磷脂酰肌醇3 激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt） 信号通路、血管内皮生长因子（VEGF） 信号通路等发挥治疗作用。结论：交泰调脉方可能通过调控PI3K-Akt 信号通路，以调节心肌细胞凋亡和血管新生等心脏重构过程，改善心肌细胞低氧耐受水平，加强心肌缺血再灌注损伤的心肌保护作用，且降脂、降糖调节内分泌水平，以治疗冠心病。]]></description>
<pubDate>2022/1/10 18:29:29</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[杨嫄，陶国水，吴波，陆曙，孔令豪]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202201005杨嫄25-34]]></guid><cfi:id>11</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学及分子对接技术分析远志治疗原发性失眠作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20222302陈旭7-14]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：基于网络药理学及分子对接技术分析远志治疗原发性失眠（PI） 的作用机制。方法：通过
Herb、Batman-TCM 数据库筛选远志的化合物，用Swiss Target Prediction、SEA 及Batman-TCM 数据库行主要
活性成分潜在靶点筛选，同时在Gene Cards、NCBI 基因、TTD 数据库筛选疾病相关靶点。将远志的主要活性
成分靶点与疾病靶点输入Venny2.1 行交集处理，筛选两者的共同靶点，运用Cytoscape3.8.0 软件构建“药物-
成分-疾病-靶点”PPI 网络并行拓扑分析。使用RStudio4.0.3 软件行基因本体（GO） 功能富集与京都基因和基
因组百科全书（KEGG） 通路富集分析，使用Discovery Studio 软件将远志主要活性成分与疾病核心靶点进行分
子对接。结果：筛选出远志中含有金丝桃苷、α-菠甾醇、芦丁、槲皮素等9 种主要活性成分，261 个药物潜
在作用靶点，与2 600 个PI 相关疾病靶点取交集后获得87 个共有靶点。拓扑分析筛选到白细胞介素-6（IL-6）、
肿瘤坏死因子（TNF）、人环磷酸腺苷反应元件结合蛋白1（CREB1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、丝裂
原活化蛋白激酶3（MAPK3） 等36 个关键靶点。GO 功能富集分析得到BP 条目1 302 项、MF 相关条目101 项、
CC 相关条目63 项；KEGG 通路富集分析筛选到神经活性配体-受体相互作用、γ-氨基丁酸（GABA）、磷脂酰
肌醇3-激酶/蛋白激酶-B（PI3K-Akt）、环磷酸腺苷（cAMP）、TNF 等79 条信号通路；分子对接显示远志主要
活性成分与疾病核心靶点亲和力均良好。结论：远志能够通过多成分、多靶点、多通路的协同作用影响机体的
神经代谢、氧化应激及炎症反应，从而发挥治疗PI 的作用。]]></description>
<pubDate>2023/1/1 18:13:49</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[陈旭，张星平，梁瑞宁，闫德祺，梁政亭]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20222302陈旭7-14]]></guid><cfi:id>10</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学探讨桂枝-白芍药对治疗类风湿性关节炎作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20222301种凯艳1-7]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：基于GEO 基因芯片、生物信息学及分子对接技术探讨桂枝-白芍药对治疗类风湿性关节炎（RA） 的作用机制。方法：通过GEO 数据库下载RA 的基因芯片数据集，利用R 软件筛选出差异表达靶点；通过TCMSP、PharmMapper 等数据库获取桂枝-白芍药对的化学成分、药物靶点，运用Cytoscape 3.9.1、R软件对药物-疾病交集靶点进行蛋白互作（PPI） 网络拓扑分析；应用clusterProfiler 等程序包对于交集靶点进行基因本体（GO）、京都基因和基因组（KEGG） 富集分析；使用AutoDock Vina 等软件进行分子对接初步验证。结果：共获得17 个药物化学成分，RA 靶点3 781 个、药物靶点410 个；筛选出药物-疾病交集靶点98 个。PPI 拓扑分析得出的核心靶点有基质金属蛋白酶-9 （MMP-9）、基质金属蛋白酶-2 （MMP-2）、过氧化氢酶（CAT）、丝氨酸蛋白酶抑制剂家族A 成员1（SERPINA1）、组织蛋白酶B（CTSB） 等；桂枝-白芍药对治疗RA 主要化学化合物有二氢槲皮素、β-谷甾醇、（+） -儿茶素、芍药苷等。潜在作用靶点参与了胶原分解代谢过程、细胞外基质分解、炎症反应调节等生物过程，涉及通路有溶酶体、过氧化物酶体增殖物激活受体（PPAR） 信号通路、细胞色素P450 代谢等。分子对接显示，桂枝-白芍药对主要化学化合物与核心靶点间结合能有较高的结合活性。结论：桂枝-白芍治疗RA 多靶点、多成分、多途径的作用机制，为桂枝-白芍药对的后续研究提供了理论依据。]]></description>
<pubDate>2022/12/11 0:22:34</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[种凯艳，兰祝飚]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20222301种凯艳1-7]]></guid><cfi:id>9</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于GEO 芯片联合网络药理学探讨化瘀通络汤治疗缺血性脑卒中作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20222103王小军13-19]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：基于GEO 芯片联合网络药理学探讨化瘀通络汤治疗缺血性脑卒中（IS） 的作用机制。方法：通过GEO 芯片结合GeneCards 数据库获取IS 的疾病靶点，利用TCMSP、文献检索结合SwissTargetPrediction 筛选出化瘀通络汤治疗IS 的有效成分和作用靶点，通过STRING 数据库与Cytoscape 3.8.2 软件构建蛋白质相互作用（PPI） 网络及拓扑分析，采用DAVID 数据库和R 语言对共同靶点进行GO 功能及KEGG 通路富集分析，并对化瘀通络汤的主要成分与关键治疗靶点进行分子对接验证。结果：共筛选出疾病靶点3 964 个，化瘀通络汤作用靶点565 个，化瘀通络汤治疗IS 的关键靶点有非受体酪氨酸激酶（Src）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、表皮生长因子受体（EGFR） 等；富集分析主要涉及神经活性配体-受体相互作用通路、癌症通路、缺氧诱导因子-1 信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路等。分子对接结果显示，化瘀通络汤主要活性化合物（木犀草素、槲皮素） 与主要治疗靶点（Src、EGFR） 有较高的结合效能。结论：化瘀通络汤可能通过作用于Src、EGFR 等核心靶点，减轻神经炎症反应、促进血管新生等多个方面发挥治疗IS 的作用。]]></description>
<pubDate>2022/11/15 13:31:27</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[王小军，彭慧渊，汪峰，许航敏]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/20222103王小军13-19]]></guid><cfi:id>8</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学联合GEO 芯片探讨肾气丸治疗肾小管上皮间质转化的作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202217002潘蛟8-16]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：基于网络药理学联合GEO 芯片差异基因分析方法探讨肾气丸治疗肾小管上皮间质转化（EMT） 的作用机制，动物实验进一步验证肾气丸治疗EMT 的作用靶点。方法：依据中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP） 和BATMAN-TCM 数据库筛选出肾气丸的活性成分及其对应靶点，利用GEO 数据库获取疾病相关靶点， 通过Cytoscape3.7.0 软件绘制“ 药物-成分-靶点” 网络。使用STRING 数据库与Cytoscape3.7.0 软件绘制核心靶点蛋白相互作用网络，并利用R 语言对核心靶点进行GO 功能和KEGG 通路富集分析。通过实时荧光定量PCR 验证肾气丸对苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、细胞分裂周期蛋白20（CDC20）、表皮生长因子受体（EGFR）、核受体辅激活蛋白1（NCOA1）、细胞周期蛋白B1（CCNB1） mRNA 的影响。结果：共得到肾气丸活性成分229 个，预测作用靶点共1 331 个，与EMT GEO 芯片共同靶点共221 个。肾气丸治疗EMT 主要作用于AKT1、CDC20、EGFR、NCOA1、CCNB1 等靶点。GO 富集分析涉及到营养物质反应、金属离子反应、氧化应激反应等多种生物过程，KEGG 富集分析得到cAMP 信号通路、钙信号通路、甲状腺激素信号通路、催产素信号通路、HIF-1 信号通路等多条信号通路。实时荧光定量PCR 证明肾气丸治疗可升高腺嘌呤造模小鼠肾组织中AKT1 mRNA 表达，降低CDC20、EGFR 和CCNB1 mRNA 表达（P＜0.05）。结论：基于网络药理学方法及实验验证，初步阐明肾气丸可通过调节AKT1、CDC20、EGFR、CCNB1 mRNA 表达来改善EMT，其作用机制可能与cAMP 信号通路、钙信号通路等多条信号通路有关。]]></description>
<pubDate>2022/9/6 18:20:45</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[潘蛟，周小杰，邱璐琦]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202217002潘蛟8-16]]></guid><cfi:id>7</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学研究消瘀泄浊饮治疗慢性肾功能衰竭的作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202216001丁越越1-8]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：利用网络药理学方法研究消瘀泄浊饮治疗慢性肾功能衰竭（Chronic Renal Failure，CRF）的分子机制。方法：采用TCMSP 与化学专业数据库及文献收集消瘀泄浊饮的有效活性成分和作用靶点。在GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD 数据库中获得CRF 相关靶点，对消瘀泄浊饮药物靶点和CRF 相关基因取交集。使用Cytoscape 3.7.2 软件构建“药物活性成分-CRF-靶点”网络，将交集靶点导入STRING 数据库，构建蛋白质相互作用网络（PPI），借助Metascape 在线工具对关键靶点进行GO 功能富集分析、KEGG 通路富集分析，并用Autodock vina 和Chimera-1.14 软件对蛋白和活性成分进行分子对接。结果：通过筛选获得消瘀泄浊饮主要活性成分68 个，249 个靶点基因；CRF 相关基因共1 533 个；交集靶点101 个。消瘀泄浊饮治疗CRF 的关键靶点为黄芪、川牛膝、车前草的共同主要成分AKT1，IL-6，以及大黄、黄芪、桃仁、川牛膝、车前草的共同主要成分PTGS2 等。KEGG 富集分析筛选出包括HIF-1 信号通路、PI3K/Akt 信号通路、NF-κB 信号通路、JAK-STAT 信号通路在内的185 条通路，生物过程主要涉及对氧化应激的反应、凋亡、活性氧代谢等。分子对接结果显示，消瘀泄浊饮中槲皮素、木犀草素、芦荟大黄素等关键化合物与IL-6、PTGS2 等关键靶点有较好的结合能力。结论：消瘀泄浊饮治疗CRF 的作用机制可能是通过槲皮素、木犀草素、芦荟大黄素等活性成分，经HIF-1、PI3K/Akt、NF-κB、JAK-STAT 等信号通路，作用于IL-6、PTGS2 以调节细胞凋亡、氧化应激、脂多糖反应、活性氧代谢等多个生物过程，最终达到延缓CRF 进展的作用。]]></description>
<pubDate>2022/8/28 12:26:27</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[丁越越，孙华洁，陈文文，陈智渊，叶晴晴，马红珍]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202216001丁越越1-8]]></guid><cfi:id>6</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学与分子对接探讨风引汤治疗癫痫作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202215002邱璐琦6-14]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：基于网络药理学与分子对接探讨风引汤治疗癫痫的潜在作用机制，并通过动物实验验证其预测靶点的可靠性。方法：结合文献，借助TCMSP、CTD 数据库，获取风引汤的活性成分及其相关分子靶点；通过GeneCards、DisGeNET、TTD 和OMIM 数据库检索癫痫相关的基因，运用Cytoscape3.7.0 软件构建风引汤治疗癫痫的蛋白相互作用网络和成分-靶点网络，筛选出风引汤治疗癫痫的关键靶点；利用R 软件将关键靶点进行GO 功能和KEGG 通路富集分析；通过分子对接进行半柔性对接反向验证并运用实时荧光定量PCR法对关键靶点进行验证。结果：筛选出风引汤治疗癫痫的活性成分134 个，与癫痫的共有靶点46 个，其中风引汤抗癫痫的关键靶点主要包括半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3（CASP3）、转录因子AP-1（JUN）、Myc 原癌基因蛋白（MYC）、前列腺素G/H 合成酶2（PTGS2） 和过氧化氢酶（CAT） 等，涉及信号通路有AGE-RAGE 信号通路、p53 信号通路、神经退行性信号通路等。实时荧光定量PCR 实验证明风引汤能降低癫痫大鼠海马中CASP3、JUN mRNA 表达（P＜0.05），升高CAT mRNA 表达（P＜0.05）。结论：风引汤治疗癫痫主要作用靶点与CASP3、JUN、CAT 有关，其作用机制可能与AGE-RAGE、p53、神经退行性等信号通路相关。]]></description>
<pubDate>2022/8/4 10:57:34</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[邱璐琦，丁舒飞，蒋东晓，阮叶萍]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202215002邱璐琦6-14]]></guid><cfi:id>5</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学和分子对接技术研究五达颗粒治疗胃肠动力障碍的分子机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202214002曾海平7-14]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：利用网络药理学和分子对接技术研究分析五达颗粒治疗胃肠动力障碍 （Gastrointestinalmotility disorder，GMD）的分子机制。方法：采用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）收集五达颗粒有效成分及其作用靶点，GeneCards 与 OMIM 数据库收集胃肠动力障碍相关靶点，Cytoscape 软件构建“成分-靶点”网络，STRING 数据库构建靶点蛋白 PPI 网络，所获关键靶点行 GO 生物功能注释及 KEGG 通路分析，五达颗粒核心活性成分及胃肠动力障碍关键靶点用 AutoDockTools 软件行分子对接。结果：“成分-靶点”网络显示五达颗粒核心活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇及山奈酚；PPI 网络显示 JUN、IL-6 及 FOS 等蛋白作用显著；GO 功能富集为信号转导、炎症反应及免疫反应等；KEGG 通路富集在 TNF 及 IL-17 等信号通路；分子对接结果显示核心活性成分与关键靶点均有较好的结合活性。结论：五达颗粒治疗 GMD 的作用机制可能是槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇及山奈酚作用于 JUN、IL-6 及 FOS 以调节信号转导、炎症反应及免疫反应。]]></description>
<pubDate>2022/7/21 14:47:41</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[曾海平，曹立幸，陈志强]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202214002曾海平7-14]]></guid><cfi:id>4</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学探究二陈汤治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202212001孟德钢1-8]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：基于网络药理学初步探究二陈汤治疗慢性阻塞性肺疾病（COPD） 的作用机制。方法：通过建立二陈汤药物靶点数据集、COPD 疾病靶点数据集，构建二陈汤治疗COPD“成分-靶点-疾病”交互网络，并进行可视化分析，预测二陈汤治疗COPD 的作用机制。结果：通过构建“成分-靶点-疾病”交互网络，发现二陈汤主要活性成分为：黄芩素（baicalein）、豆甾醇（stigmasterol）、β-谷甾醇（beta-sitosterol）、槲皮素（quercetin）、异鼠李素（isorhamnetin）、维采宁-2（vicenin-2） 可直接作用于细胞周期蛋白E（cyclin E1，CCNE1）、细胞周期蛋白依赖性激酶1（cyclin dependent kinase 1，CDK1）、细胞周期蛋白依赖性激酶2 （cyclin dependent kinase 2，CDK2）、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A （cyclin dependent kinase inhibitor 1A，CDKN1A）、转化生长因子β1（transforming growth factor beta 1，TGFβ1）、肿瘤蛋白质p53（tumor protein p53，TP53）、增殖细胞核抗原（proliferating cell nuclear antigen，PCNA）、B 细胞中kappa 光多肽基因增强子抑制剂，激酶β （inhibitor of kappalight polypeptide gene enhancer in B-cells，kinase beta，IKBKβ）、转化生长因子受体1（transforming growth factor beta receptor 1，TGFβR1）、热休克蛋白90 α 家族A 类成员（heat shock protein 90 alpha family class A member 1，HSP90αA1） 发挥治疗作用。通过KEGG 通路富集分析，筛选出16 条相关生物学通路。通过GO 通路富集分析，筛选出30 条相关生物学通路。结论：二陈汤主要通过CCNE1、CDK1、CDK2、CDKN1A、TGFβ1、TGFβR1、PCNA、TP53、IKBKβ、HSP90αA1 等靶标干预COPD 引发的炎症反应、细胞衰老、组织重构等机制，达到控制COPD 发生与发展的目的。]]></description>
<pubDate>2022/6/22 9:37:05</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[孟德钢，凌玲]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202212001孟德钢1-8]]></guid><cfi:id>3</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学和分子对接探讨冠心宁片治疗心力衰竭作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202212002安宜沛9-15]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：采用网络药理学和分子对接的方法，研究中成药冠心宁片治疗心力衰竭（HF） 的作用机制。方法：通过TCMSP 数据库获取冠心宁片所含中药的活性成分和药物成分的潜在靶点；检索Therapeutic Target Database（TTD）、Drugbank 数据库查找与HF 相关的疾病靶点；将药物靶点与疾病靶点经过Uniprot 数据库校正后取交集基因，得到冠心宁片治疗HF 的“成分-靶点-疾病”网络。采用STRING 数据库和DAVID 数据库对交集基因进行PPI 分析、GO 富集分析及KEGG 信号通路富集分析。最后运用AutoDock Vina、ChemBio3D Ultra、PyMOL 等软件对冠心宁片关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证。结果：从冠心宁片中共获得33 个药物活性成分，92 个药物靶点，TTD、Drugbank 数据库获得与HF 相关的140 个疾病靶点，最终获得16 个药物与疾病的交集基因。预测冠心宁片中主要成分有丹参酮ⅡA、二氢丹参内酯、4-亚甲丹参新酮、2-异丙基-8-甲基菲-3，4-二酮、隐丹参酮等，作用于NR3C1、PPARG、MMPs、CHRM2、DRD2 等16 个HF 的靶点基因，通过神经活性配体-受体交互作用通路、cGMP-PKG 信号通路、cAMP 信号通路、Ca2+信号通路、肿瘤相关信号通路等发挥治疗作用。分子对接验证了冠心宁片主要成分丹参酮ⅡA 和主要靶点基因NR3C1 的结合活性，发现二者结合度高且稳定。结论：通过网络药理学验证了冠心宁片治疗HF 多成分、多靶点、多通路的特点，其可能是通过调控DNA/RNA 的转录、调节体液-激素相关的信号转导及调节平滑肌收缩来影响心室重塑和调节心肌的收缩力，达到治疗作用。]]></description>
<pubDate>2022/6/22 9:37:05</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[安宜沛，陈鹏，陈彦，王新陆，王永霞，丁天祥，姚耿圳]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202212002安宜沛9-15]]></guid><cfi:id>2</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
<item>
<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于网络药理学探讨麻杏二三汤治疗支气管哮喘作用机制]]></title>
<link><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202210001叶威1-8]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[目的：联合网络药理学数据库研究麻杏二三汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法：运用传统中药系统药理学数据库和分析平台与有机小分子生物活性数据库获取麻黄、苦杏仁、陈皮、半夏、茯苓、紫苏子、莱菔子、白芥子、诃子、甘草的有效成分及对应靶点；从人类基因数据库和在线人类孟德尔遗传数据库获取支气管哮喘相关靶标，同时利用Venny 2.1 在线网络获取交集基因；运用Cytoscape（Version3.7.2） 和STRING 数据库构建药物-成分-靶标-疾病网络图和蛋白质-蛋白质相互作用网络，进而运用cytoHubba 插件鉴定出核心靶标。最后，运用Metascape 数据库进行基因本体（GO） 富集分析与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：研究筛选得到麻杏二三汤治疗支气管哮喘的主要治疗靶标包括血管内皮生长因子A（VEGFA）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、禽肉瘤病毒17（JUN）、p53 肿瘤蛋白（TP53）、信号转导及转录激活蛋白3（STAT3）、促分裂素原活化蛋白激酶3（MAPK3）、前列腺内过氧化物合成酶2（PTGS2）、促分裂素原活化蛋白激酶1（MAPK1）、半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶3（CASP3）等，涉及磷酯酰肌醇-3-激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶（PI3K-AKT）信号通路、白细胞介素-17（IL-17）信号通路、晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体（AGE-RAGE） 信号通路、TNF 信号通路、肿瘤信号通路等。结论：麻杏二三汤通过多成分、多靶标、多通路共同发挥治疗支气管哮喘的作用。]]></description>
<pubDate>2022/5/24 11:04:44</pubDate>
<category><![CDATA[网络药理]]></category>
<author><![CDATA[叶威，李星星]]></author>
<guid><![CDATA[http://xzy.ijournal.cn/xzy/article/abstract/202210001叶威1-8]]></guid><cfi:id>1</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
</channel>
</rss>