目的：采用网络药理学与分子对接方法，探讨黄连解毒汤治疗阿尔茨海默病（AD）与癫痫（EP）的作用机制。方法：利用TCMSP、BATMAN、ETCM、HERB、SYMMAP及TCMID等数据库预测黄连解毒汤成分及靶点；从GeneCards、CTD、OpenTargets获取AD与EP相关靶点；通过STRING与Cytoscape筛选核心交集靶点并进行可视化分析。利用R语言进行GO与KEGG富集分析，构建成分-交集靶点-通路网络；运用AutoDock Tools对关键配体与受体蛋白进行分子对接验证。结果：共筛选出黄连解毒汤中132个活性成分，1439个活性成分靶点，229个疾病相关靶点，药物成分与AD、EP共152个交集靶点；GO功能富集分析筛选出2231个生物过程条目，85个细胞组成条目，147个分子功能条目；KEGG筛选出192条通路，主要涉及TNF、脂质与动脉粥样硬化及AGE-RAGE等通路；分子对接黄连解毒汤的提示关键成分与核心靶点结合良好。结论：黄连解毒汤通过多组分-多靶点-多通路协同发挥异病同治AD与EP的作用，为其临床应用提供理论依据。